（新）北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院是北京中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院，是國家中醫(yī)藥管理局直管單位，是全國三級甲等中醫(yī)醫(yī)院。教育部211工程建設(shè)的僅有一所中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院，是北京市醫(yī)療保險定點醫(yī)院?？傉嫉孛娣e31231.62平方米，已建筑面積87264平方米，由醫(yī)療主樓、醫(yī)療南樓、教學(xué)科研樓、制劑樓及配套設(shè)施組成。

東方醫(yī)院作為北京中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院，為國家培養(yǎng)了一批高素質(zhì)專門人才。學(xué)院現(xiàn)設(shè)有中醫(yī)內(nèi)科專業(yè)、中醫(yī)外科專業(yè)、中醫(yī)婦科專業(yè)、中醫(yī)兒科專業(yè)、針灸推拿專業(yè)、中西醫(yī)結(jié)合臨床專業(yè)等11個招生專業(yè)，建有中醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合博士后流動站，現(xiàn)有博士學(xué)位授權(quán)點6個，碩士學(xué)位授權(quán)點11個，共設(shè)內(nèi)、外、婦、兒等18個教研室，擁有臨床實習(xí)床位643張，是全國中醫(yī)藥高等教育學(xué)會臨床教育研究會的常務(wù)理事單位等。現(xiàn)共有博碩導(dǎo)師近100名，有7名專家享受政府特殊津貼，有3名專家被國家確定為師承制教育導(dǎo)師。目前，該院承擔(dān)有我校七年制臨床方向、科研方向班及“北中醫(yī)-新加坡南洋理工大學(xué)合作雙學(xué)位項目”班臨床課授課、畢業(yè)實習(xí)，五年制學(xué)生畢業(yè)實習(xí)等教學(xué)任務(wù)。

圍繞中醫(yī)藥防治重大、疑難、常見疾病主題開展了科學(xué)研究480項，包括科技攻關(guān)/支撐計劃課題、973計劃課題、國家重大新藥創(chuàng)制科技專項、國家自然科學(xué)基金項目、中醫(yī)藥行業(yè)專項課題等國內(nèi)高級項目43項，獲各級新加坡南洋理工大學(xué)科技成果獎35項。2009年獲國家中醫(yī)藥管理局細(xì)胞分子技術(shù)三級實驗室稱號。目前擁有6個北京市名老中醫(yī)工作室站建設(shè)項目，承擔(dān)教育部“211”工程三期重點學(xué)科建設(shè)項目，是國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科、重點研究室建設(shè)單位。