醫(yī)院成立于2001年6月6日，是眼科三級(jí)專科醫(yī)院（分為臺(tái)江和倉(cāng)山兩個(gè)院區(qū)），冠名福州東南眼科紅十字醫(yī)院，福州市醫(yī)學(xué)會(huì)眼科學(xué)分會(huì)掛靠單位，國(guó)家住院醫(yī)師規(guī)培基地，福建省眼鏡協(xié)會(huì)驗(yàn)光配鏡技術(shù)培訓(xùn)和鑒定基地，高校教學(xué)醫(yī)院，與福建省衛(wèi)生技術(shù)學(xué)院聯(lián)合開辦眼視光專業(yè)、閩江學(xué)院開展校企合作--共同建設(shè)物聯(lián)網(wǎng)醫(yī)院，分別是全國(guó)眼視光聯(lián)盟理事單位、上海市第九醫(yī)院?？坡?lián)盟和福州市第一醫(yī)院醫(yī)療聯(lián)合體成員單位；分別是國(guó)家重大公共衛(wèi)生項(xiàng)目“百萬(wàn)貧困白內(nèi)障患者復(fù)明工程”、福建省委省政府為民辦實(shí)事“光明行動(dòng)”項(xiàng)目、福建省紅十字光明天使行動(dòng)和福州市慈善定點(diǎn)醫(yī)院，福建省見義勇為人員眼科救治中心，福建省視覺障礙康復(fù)中心，省、市兩級(jí)科普教育基地，福州市低視力康復(fù)部，福州市青少年學(xué)生第二課堂，福州科技館眼健康分館，倉(cāng)山區(qū)和臺(tái)江區(qū)兒童青少年近視防控中心掛靠單位。至2018年底，醫(yī)院共為399萬(wàn)眼病患者提供專業(yè)的診療服務(wù)，完成各類眼病手術(shù)39萬(wàn)臺(tái)；共深入農(nóng)村、社區(qū)、學(xué)校開展義診普查超過(guò)4750場(chǎng)次，多次參與西藏、寧夏、甘肅、新疆、臺(tái)灣馬祖等地區(qū)的眼科支援工作，開展“一帶一路·緬甸仰光光明行”國(guó)際援助，為超過(guò)65萬(wàn)名群眾免費(fèi)檢查眼病，免費(fèi)發(fā)放眼病防治科普資料300多萬(wàn)份；幫助25513名貧困白內(nèi)障、胬肉等眼病患者實(shí)施復(fù)明扶貧手術(shù)；被中華醫(yī)學(xué)會(huì)眼科學(xué)分會(huì)授予“全國(guó)消除白內(nèi)障突出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)單位”，在2017年、2018年分別完成白內(nèi)障手術(shù)13408例、16635例。
醫(yī)院設(shè)有白內(nèi)障超聲乳化、全飛秒激光治療近視、青光眼、角膜病、眼底病、眼外傷、玻璃體視網(wǎng)膜病、葡萄膜病、神經(jīng)眼科、眼遺傳病、眼整形、眼眶病、眼眶腫瘤、淚器病、眼表疾病、斜視弱視、小兒眼科、醫(yī)學(xué)驗(yàn)光配鏡、中醫(yī)眼科、低視力康復(fù)、眼健康管理、眼部整形等20多個(gè)專業(yè)組，與國(guó)際同步開展各種眼科前沿技術(shù)和微創(chuàng)治療。其中，三焦點(diǎn)屈光白內(nèi)障、三焦點(diǎn)老視矯正、全飛秒激光治療近視、微小切口超聲乳化治療白內(nèi)障、微創(chuàng)玻璃體切割手術(shù)治療眼外傷和玻璃體視網(wǎng)膜病、眼視光學(xué)醫(yī)學(xué)驗(yàn)光配鏡等多項(xiàng)技術(shù)處于目前眼科領(lǐng)域的前沿，具有眼科專業(yè)精細(xì)化、醫(yī)生專業(yè)化、設(shè)備現(xiàn)代化、服務(wù)人性化、管理科學(xué)化的專科特色。
醫(yī)院凝聚了一批致力于眼科事業(yè)發(fā)展的人才隊(duì)伍，現(xiàn)有員工500余人，其中眼科專家和眼科醫(yī)師近150人（高級(jí)職稱占約40%），已形成老中青相結(jié)合的梯隊(duì)型眼科專業(yè)人才優(yōu)勢(shì)，并定期邀請(qǐng)國(guó)內(nèi)外眼科專家來(lái)院講學(xué)、會(huì)診、學(xué)術(shù)研討，主編《中華眼科學(xué)。神經(jīng)眼科學(xué)分卷》，參編全國(guó)高校五年制、七年制、八年制《眼科學(xué)》教材，獲得國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)一項(xiàng)。醫(yī)院本著“以醫(yī)療質(zhì)量為生命，盡心、盡責(zé)、盡力；以患者需求為中心，真誠(chéng)、熱情、關(guān)愛”的理念，實(shí)現(xiàn)自身的追求、責(zé)任和使命。擁有世界先進(jìn)的眼科診斷和治療設(shè)備，構(gòu)成強(qiáng)有力的硬件技術(shù)保障。
醫(yī)院環(huán)境優(yōu)雅、設(shè)施完備、裝備精良、專業(yè)齊全、技術(shù)先進(jìn)，是集眼科臨床、教學(xué)、科研、防盲、近視防控和科普為一體的大型眼科?？漆t(yī)院。醫(yī)院占地面積近50畝，醫(yī)療建筑面積近5萬(wàn)平方米，設(shè)置床位300張（二期將建設(shè)9萬(wàn)平方米醫(yī)療用房，增加床位600張），配備15間層流凈化手術(shù)室，300多個(gè)停車泊位，眼科規(guī)模位居全國(guó)前列。
近幾年，醫(yī)院為了將三級(jí)眼科的優(yōu)質(zhì)技術(shù)資源延伸到基層，率先在全省成立眼健康促進(jìn)聯(lián)盟；在福安、福清、三明、連江、南平、漳州、泉州、南京、撫州、武漢、合肥等地開設(shè)了東南眼科連鎖醫(yī)療機(jī)構(gòu)，實(shí)行集團(tuán)化運(yùn)營(yíng)和管理，讓廣大人民群眾在家門口分享到東南眼科的精準(zhǔn)、優(yōu)質(zhì)、便捷、個(gè)性化的眼科專業(yè)診療服務(wù)。今后，醫(yī)院將繼續(xù)秉持“為大眾提供可及的、專業(yè)的眼科醫(yī)療服務(wù)”宗旨，以“掃除盲患播撒光明”為使命，“以科技締結(jié)光明”的經(jīng)營(yíng)哲學(xué)，珍惜每一位患者，積極投身眼科醫(yī)療健康事業(yè)，助力健康中國(guó)。